水环境是人类社会赖以生存和发展的重要场所，也是容易受干扰和破坏较为严重的领域，东海县把治理水环境作为水生态文明建设的重中之重，把生态理念贯穿于水环境治理的各个环节。在城区水系治理中，按照"先清淤、后截污，先治理、后换水"的思路，投入8400万元对玉带河、自清河、石英河以及郑庄水库、英疃水库等水系进行综合治理，并定期调取西双湖水源，对城区水系进行生态补水，改善城区水环境。在农村水系治理中，实施投资2.7亿元的中小河流治理重点县综合整治和水系连通试点工程，计划到2016年用三年时间疏浚河道 415公里 、整治岸坡 232公里 、加固堤防 113公里 。这些项目在进行建设设计时，注重生态公园、亲水平台、生态绿地等配套设施建设，注重发挥其生态、景观、休闲、文化等综合作用，不断让人民群众亲近河道水域、感受河道的生机与魅力。在保障河道行洪排涝、蓄水输水的基本水利功能的同时，在靠近村庄、镇区段，采用8字型植草砖、自嵌式景观挡土墙、铰链式护坡砖等新型建材，配种狗牙草、乔木等，增加水土的交换，为水生物营造良好的生存环境，避免了简单采取硬化、渠化等传统措施，保持了河流的自然生态环境，也为人民群众的工作、生活创造了良好的水体环境。